1.地下害虫防治
大豆苗期地下害虫主要有地老虎、金针虫、蛴螬、蝼蛄等，以地老虎为主，发现危害后，喷施敌杀死等药剂。
蛴螬等害虫严重地块可用毒肥缓释颗粒剂土壤处理，可使用0.5%毒死蜱微胶囊复合毒肥(N-P-K含量15%-15%-15%)，每亩施用量10公斤。也可采用菌制剂替代部分化学制剂进行防治，可施用0.48 kg/亩白僵菌+0.24 kg/亩毒死蜱或0.48 kg/亩绿僵菌+0.24 kg/亩毒死蜱或0.24 kg/亩绿僵菌+0.24 kg/亩毒死蜱，可根据当地虫口基数调整施用剂量。
2.食叶性害虫
大豆苗期食叶性害虫主要有菜青虫、棉铃虫等，可选用20%氯虫苯甲酰胺悬浮剂、20％杀灭菊酯乳油、5％农梦特乳油2000～2500倍液，2.5％功夫菊酯乳油2000～3000倍液，80％敌敌畏乳油、25％喹硫磷乳剂1000倍液进行田间喷雾防治。
3.钻蛀类害虫
大豆苗期钻蛀类害虫主要是豆秆蝇，可进行播种期预防和生长期防治。
播种期预防：大豆出苗前施用3％米乐尔颗粒剂1.5kg/亩拌细沙土10kg均匀撒施于垄（畦）上。
生长期防治：在豆苗出土后，应立即施药预防。在成虫盛发期可使用40％乐果或菊酯类农药加50％辛硫磷乳油，每亩用量50～70mL，稀释1000倍后作叶面喷雾，对成虫有较好的防治效果，隔6～7天再防治一次。发生严重时，隔5～7天喷药1次，连喷3～4次。防治药剂可选择48％毒死蜱乳油或52.25％农地乐乳油1000倍液，90％万灵可湿性粉剂3000倍液等，不同药剂交替使用。