在同一块土壤中连续种植同一种或同科作物，在正常管理下，出现了生长势弱、产量低、品质差、病害严重的现象为连作障碍。连作障碍已成为目前设施蔬菜生产中的一大难题，严重制约着设施蔬菜发展。
一、土壤连作障碍成因
1．有害微生物的积累。因为设施土壤一年四季均具有病原菌生长繁殖适宜的温度，使得土壤中病原菌数量不断增加，同时设施栽培中化肥的过多使用也导致土壤中病原拮抗的减少，更加助长了病原菌的繁殖。
2．营养不均衡。连续多年在同一地块上种植同一种作物，而同一种作物吸收的营养相同，从而造成某种营养成分含量较低，致使养分比例失调，尤其是一些微量元素缺乏。
3．盐分积累。一是设施蔬菜过量施用化肥和偏施氮肥导致土壤盐类物质的积聚；二是棚室常年覆盖，缺少降雨淋溶，引起盐分在表土层积累。
4．土壤结构及酸碱度的变化。长期连作，土壤中有机质含量会降低，土壤团粒结构遭到破坏，同时土壤中某种微生物群体大量增加，引起土壤酸碱度的变化。
5．蔬菜的自毒作用。一些植物可通过地上部淋溶、根系分泌物和植物残茬腐解等途径来释放一些物质对同茬或下茬同种或同科植物生长产生抑制作用。
二、防治措施
1．选用抗病品种。选用对病虫害如枯萎病、黄萎病、根结线虫具有高抗或多抗的蔬菜品种。
2．合理轮作。采用瓜菜与禾本科、豆科等不同作物轮作，可以断绝病原菌的营养源，减轻病虫害的发生等是有效防止连作障碍的有效措施。
3．客土栽培。将棚室耕作层的土壤换成新土进行生产，此法效果很好，但费工费时。
4．土壤消毒。利用药剂、高温和水淹等方法也是消除蔬菜连作障碍的有效措施。药剂消毒。可消灭土壤中病菌和根结线虫。如溴甲烷、硫磺粉熏蒸，或使用多菌灵、农用链霉素等。高温和水淹闷棚。是将棚室密闭高温处理，连续晒7-10天，夏季土壤温度可达到50℃以上，能杀死大部分细菌和害虫，减轻土传病虫危害。
5．嫁接换根技术。利用砧木高抗枯萎病、黄萎病、根腐病等土传病害及抗逆性强、根系吸收能力强的特性，增加植株光合能力，来克服棚室连作障碍。如利用南瓜与黄瓜、甜瓜嫁接等方法来提高植物的抗逆性。
6.合理施肥。采取测土施肥、配方施肥、平衡施肥的方法。一是增施有机肥。可有效改良土壤，促进根系生长发育，增强根系吸水吸肥能力，提高作物自身抗病性。二是推广配方施肥。按作物需肥要求和土壤供肥能力，科学施肥，严格控制氮素化肥的用量，注意微量元素肥料的使用，合理使用氮、磷、钾复合肥和有机、无极复合肥。三是施用微生物菌肥。改善土壤养分状况，增加土壤中有益微生物，显著地提高土壤肥力，增加植物养分的供应量，促进植物生长。
