碧桃的病虫害常发于夏、秋两季，其主要病害有：穿孔病、炭疽病、流胶病、缩叶病。主要虫害有蚜虫、红蜘蛛、介壳虫、红颈天牛等。冬季在主干及粗壮枝上涂白，对防治天牛繁衍幼虫有较好的效果。
1．缩叶病
主要危害碧桃幼叶部分，以侵染叶片为主，春季嫩梢刚抽发就呈卷曲状，颜色发红，叶片逐渐增厚变脆，并呈红褐色，严重时全株叶片变形，枝梢枯死，春末夏初叶表面生出一层灰白色粉状物，为病菌子囊层。防治方法：在病叶初现，未形成白粉状物前及时摘除病叶，集中烧毁，可减少当年越冬菌源；药剂防治碧桃缩叶病效果明显，但用药要掌握在碧桃花瓣未展开时，可喷施波美2～3度石硫合剂或1%波尔多液或70%可湿性粉剂百菌清可湿性粉剂600倍液。7～10天1次，连续2～3次即可得到控制。
2．流胶病
主要发生在枝干上，尤其在桠杈处最易发生，果实及枝条也亦发生流胶。流出的胶先为淡黄色透明，树脂凝结渐变红褐色，病部稍肿，皮层及木质部变褐腐朽，腐生其它杂菌，树势日衰，叶小而黄，严重时，枝干枯死。诱导此病的因素很多，霜冻、日灼、虫害、真菌、生长不良、施肥或冬剪不当等等。流胶病在春季发生最盛，防止流胶病应以增强树势为中心，并注意避免各种伤口。在发芽前将病部刮除，涂以波美5度石硫合剂，然后以其它保护剂保护。发病初期，可用50%复方多菌灵悬浮剂600～800倍液，或70%可湿性粉剂甲基硫菌灵可湿性粉剂600倍液，或70%可湿性粉剂百菌清可湿性粉剂600倍液喷雾或涂抹，7～10天1次，连续2～3次即可得到控制。
3．红蜘蛛
虽然个体很小，行动能力有限，但繁殖力强，借助风力、人力及苗木传播蔓延，其活动范围广泛。以吸取树叶汁液对叶片进行危害，极易成灾，消耗树体大量养分，影响光合作用，促使树势衰弱，诱发病害发生，也影响花芽分化。虫害后，叶片呈灰斑色，严重时叶片呈红褐色，并引起叶片枯黄脱落。防治方法：越冬期用波美0.5～1度石硫合剂喷1～2遍；大发生期可用50%亚胶硫磷可湿性粉剂1000倍液喷施。
4．蚜虫
种类繁多，危害普遍。其成蚜、若蚜刺吸叶片汁液，幼叶被害后，向反面横卷，呈不规则卷缩，最后干枯脱落。成叶被害后一般叶片卷曲下垂，严重时叶表面污黑、干枯而脱落。防治方法一般用20%阿维三唑磷乳油800～1000倍液；或吡虫啉800～1000倍液；或4.5%高效氯氰菊酯乳油1000～1500倍液喷施。
